Im Folgenden wird das Installationsverzeichnis, in dem die Ja2.exe vorliegt, als JA2 Verzeichnis bezeichnet werden.
Seit dem Release "Build 11-08-05" werden die Daten in zwei Verzeichnissen aufbewahrt, einem Standard- und einem benutzerdefinierten Verzeichnis.
Die Standarddateien werden im Data Verzeichnis des JA2 Verzeichnisses aufbewahrt, und beinhalten SLF libraries und verschiedene andere Datendateien. Die Standarddateien stimmen größtenteils mit den Einstellungen in JA2 v1.12 überein und beinhalten keine neuen Waffen, Items, Charaktere usw., die erst in 1.13 eingeführt wurden. Daher gleichen die Daten und Einstellungen in Data\TableData\Weapons.xml den Waffendaten aus der 1.12er Version. Jene Standarddateien dienen als Grundlage für Mods (wie auch dem 1.13 Mod) und als eine "Standardversion" des Spiels. Man sollte vermeiden, Dateien im Data Verzeichnis hinzuzufügen, zu modifizieren oder zu löschen.
Benutzerdefinierte Daten können in einem beliebigen anderen Verzeichnis untergebracht werden: der 1.13 Mod beispielsweise verwendet das Data-1.13Verzeichnis, andere Mods und Kampagnen können ihre eigenen Verzeichnisse verwenden (siehe unten). Die benutzerdefinierten Verzeichnisse beinhalten keine SLF libraries - sondern nur einzelne Dateien in entsprechenden Unterordnern. Alles, was im gegenwärtig ausgewählten benutzerdefinierten Verzeichnis vorliegt, verdeckt oder ergänzt die Dateien im Standardverzeichnis. So wird Data\TableData\Weapons.xml beispielsweise von Data-1.13\TableData\Weapons.xml verdeckt, welche anstelle der ersteren Datei verwendet wird, wohingegen Data-1.13\Interface\MDGUNS.sti die standardmäßige Version in Data\Interface.slf ersetzt. Benutzerdefinierte Daten und Dateien müssen daher nicht den Standarddataordner duplizieren. Benutzerdefinierten Maps können im Map-Unterordner eines entsprechenden benutzerdefinierten Verzeichnisses angelegt werden. Damit können benutzerdefinierte Ordner dazu verwendet werden, benutzerdefinierte Kampagnen und Mods auszuwählen.
Zu diesem Zwecke ändere folgende Zeile in der Ja2.ini (zu finden im JA2 Verzeichnis) oder füge sie hinzu:
CUSTOM_DATA_LOCATION=Data-1.13
Um mit den Standardeinstellungen zu spielen, lösche einfach diese Zeile. In diesem Fall bleiben alle Codeänderungen wie KI- und Gameplay-Tweaks erhalten, aber Items, Waffen, Charaktere usw. werden gemäß den Standards der 1.12 Version sein.
Beachte, dass wenn du ein anderes benutzerdefiniertes Verzeichnis als das Data-1.13 Verzeichnis auswählst, die Einstellungen im Data-1.13 Ordner nicht auf deinen Mod angewendet werden. Stattdessen kannst du die Dateien aus dem Data-1.13 Ordner in dein benutzerdefiniertes Verzeichnis kopieren.
Du solltest jedoch niemals die folgenden Verzeichnisse aus dem Data Verzeichnis verschieben oder sie in ein benutzerdefiniertes Verzeichnis kopieren: Temp und ShadeTables.
Wie oben erklärt, sollten benutzerdefinierte Daten und Einstellungen nun nicht mehr im Data Ordner sondern in einem benutzerdefinierten Ordner abgelegt werden. Du kannst deine Änderungen zu dem Data-1.13 Ordner hinzufügen, oder dein eigenes benutzerdefiniertes Verzeichnis erstellen, und was immer du brauchst, von Data-1.13 ausleihen.
Um benutzerdefinierte Daten an die neue Ordnerstruktur anzupassen, folge den Installationsschritten 1 und 2b. Anstatt aber deine benutzerdefinierten Dateien zu löschen (wie z.B. XML Datendateien), verschiebe sie an einen temporären Platz, und bringe sie dann mit den Daten im Data-1.13 Ordner zusammen, oder lege sie in ein neues benutzerdefiniertes Verzeichnis ab. Die übrigen Dateien können ohne Risiko wie oben beschrieben gelöscht werden.
XML Daten werden nicht mehr in den Original_Items und New_Items Unterordnern des TableData Verzeichnisses aufbewahrt. Alle Dateien, die in diesen Unterordnern verbleiben, werden vom Programm ignoriert. Die originalen Daten sind nun im Data\TableData Ordner untergebracht, während die neuen Daten im Data-1.13\TableData Ordner vorliegen.
Ja2_Options.ini verbleibt nun in den Dataverzeichnissen: Data and Data-1.13 in dieser Distribution. Genau wie mit den anderen Dateien ist es mit der Optionsdatei so, dass jene des aktuell ausgewählten benutzerdefinierten Verzeichnisses die Standardoptionsdatei überschreibt. Wenn du sie geändert hast, solltest du deine Änderungen in die aktualisierte Datei im Data-1.13 Verzeichnis aufnehmen.
Da der 1.13 Mod für eine englische JA2 Version konzipiert worden ist, funktioniert er leider nicht 100%ig mit einer deutschen JA2 Installation. Hierfür wird jedoch ein Patch zur Verfügung gestellt, der möglichst bald nach dem Release einer neuen 1.13 Version erscheint. Dieser Patch beinhaltet momentan lediglich eine deutsch Ja2.exe, um Inkompatibilitäten mit einer deutschen Version zu beheben. Benutzer einer englischen JA2 Installation benötigen diesen Patch nicht und sollten ihn auch nicht installieren.
Diese Datei ist ihn der Patch-Sektion auf JA2 Mods.de zu finden und muss nach dem Download ins JA2 Verzeichnis entpackt werden.
Anmerkung: Es ist dringend darauf zu achten, dass der Patch das gleiche Build-Datum wie der eigentliche Mod aufweist. Niemals einen deustchen Patch installieren, der sich in der Version vom englischen Mod unterscheidet.